东南大学计算机系统结构是东南大学计算机专业最早成立的方向，在数十年的研究发展中，曾研制出中国第一台数字积分机、DJS-130电子计算机以及VGA显卡等各类嵌入式设备。进入新世纪以来，该方向致力于多核和众核结构及相关算法、可重构计算的研究。由系统结构方向带头的计算机专业本科计算机系统能力培养系列课程改革，打破了传统的各门课之间相互分割，知识点分散的弊端，形成了以系统能力培养为导向，以解决复杂工程问题为目标，纵横贯通的实践教学体系，在国内颇具影响。
  近两年，本研究室紧跟国家科技发展的新战略，积极与相关学科及企业合作。与美国XILINX公司和深圳依元素科技合作，成立了系统能力培养示范中心，开展了CPU+FPGA等异构多核技术与应用的研究与教学;与广州德晟科技合作成立了人工智能算法及芯片联合实验室，展开了对人工智能算法以及异构环境下人工智能芯片方面的研究。历年来，本研究室多次承担了各级各类科研项目、教学改革项目，多次获得省部级科学进步奖、优秀教学奖以及学校优秀教学工作奖和校教学成果奖。历届研究生共发表国际期刊及会议论文上百篇，并多次获得全国、省部级各类学科竞赛奖。
  本研究室不仅学术气氛浓厚，而且有着丰富多彩的课余文化生活，研究室设有摄影文化墙，每年举办春秋游，年终聚会等各项活动，旨在营造温馨和睦的大家庭氛围。热忱欢迎对计算机体系结构、人工智能算法及芯片、嵌入式系统等领域感兴趣的同学报考本研究室研究生，也欢迎优秀本科生参加研究室的各项科研活动。